很久以前,邪恶的黑衣夫人与其掌管的遗忘之境被远古时代的几名白羽大天使合力封印在天使之球里。随着沧海桑田,天使之球落到世界上唯一仅存的白羽天使手上,这位白羽天使将它与无数有趣的魔法道具一起藏于神秘的咕噜阁楼。多年以后的一天,白羽天使11岁的儿子小飞侠误闯咕噜阁,受到黑衣夫人的诱惑再加上自身性格问题等原因,误打误撞解开了封印,释放了黑衣夫人与遗忘之境。黑衣夫人一直嫉妒憎恨人类世界的美好,她讨厌一切快乐的东西。重获自由后,黑衣夫人用黑水晶吸收人类的负面情绪——“阴郁、烦躁、痛苦”等,为黑水晶提供能量,以实现她把人类世界变成第二个遗忘之境的邪恶计划。小飞侠和他的小伙伴们发现了黑衣夫人的阴谋,并在妈妈白羽天使的帮助下化身魔法圣斗士,与黑衣夫人斗智斗勇,并最终战胜了黑衣夫人拯救了人类世界。
《神奇小飞侠》的别名有:小魔仙之黑魔法来袭。